معاونت اداری و مالی مدرسه حج
تعریف:
معاونت اداری و مالی یکی از معاونت های مدرسه حج است که مرجع تصمیم گیری و ساماندهی امور اداری و مالی مدرسه حج می باشد.
اهداف:
1- استفاده بهینه از نیروهای انسانی و منابع مالی.
2- ارتقاء و توانمند سازی نیروهای اداری مدرسه حج.
3- تقویت بنیه اداری و پشتوانه مالی مدرسه حج.


معاونت تحقیق، برنامه ریزی و توسعه
تعریف:
معاونت تحقیق، برنامه ریزی و توسعه یکی از معاونت های مدرسه حج است که از طریق تحقیق به ارائه طرح و برنامه جهت ارتقاء و توسعه مدرسه حج اقدام می نماید.
اهداف:
1- توسعه کیفی و کمی مدرسه حج.
2- توانمند سازی نیروی انسانی.


معاونت آموزشی مدرسه حج
تعریف:
یکی از معاونت¬های مدرسه حج است که مرجع تصمیم¬گیری و مسؤول اجرای آیین¬نامه¬ها و دستور¬العمل¬های آموزشی مدارس حج می‌باشد.
اهداف:
1- ارتقای سطح علمی روحانیون که موارد زیر را شامل می‌شود.
- اهداف آموزشی.
- محتوای درسی.
- روش تدریس.
- وسایل آموزشی.
- ارزشیابی.
2- تربیت نیروهای متخصص جهت هدایت زائرین بیت الله الحرام.
3- این معاونت شامل چهار کارگروه اصلی احکام و مناسک، اسرار و معارف ، تاریخ و اماکن و کارگروه تجارب می باشد.


معاونت پژوهشی و تولید محتوا مدرسه حج
تعریف:
معاونت پژوهشی یکی از معاونت‌های مدرسه حج است که از طریق پژوهش و مطالعات مستمر مسئولیت تولید و نوآوری علمی را به عهده دارد.
اهداف:
1- ارتقای سطح علمی روحانیون
2- نهادینه شدن روحیه‌ی تحقیق، پژوهش و نوآوری علمی نزد روحانیون
3- ارتقاء کمی و کیفی پژوهش‌های مدرسه حج در سطوح ملی و بین‌المللی.


معاونت امور روحانیون
تعریف:
معاونت امور روحانیون یکی از معاونت های مدرسه حج است که مرجع تصمیم گیری و ساماندهی امور روحانیون می باشد.
اهداف:
1- تحقق اهداف مدرسه حج در ارتباط با روحانیون.
2- ارتقای امور رفاهی و خدماتی روحانیون.
3- پیشرفت روحانیون در زمینه های اجتماعی، فرهنگی و سلامت.
4- نهادینه کردن رفتار شورایی، تعاون و مسئولیت پذیری در میان روحانیون.